Lo que aparece en la pestaña de Parametrizaciones Generales>Visualizar
Los importes es lo que te aparecerá en los documentos de facturas y esos decimales suelen coincidir con la fracción más pequeña de moneda. Si tienes céntimos lo más lógico es que sólo tengas 2 decimales en los Importes.
Ahora bien, tus precios pueden tener hasta 6 decimales, y eso se explica porque los artículos que se compran o venden pueden tener precios muy, muy pequeños, por ejemplo, bolsas de plástico por 0,000008 dólares o euros o lo que sea, por unidad. Es bastante lógico pensar que nadie venderá una unidad, empezando porque no hay fracción monetaria para pagar ese precio, pero es una forma de calcular el coste unitario de los artículos de manera muy exacta.
En el caso que nos indicas -calcular precios con 4 decimales- basta con que lo indiques en esa pestaña. Si tienes un artículo que cuesta 0,0046 euros y vendes 998 unidades, el sistema te va a calcular el precio de esa venta a 4,5908, pero como tendrás definidos dos decimales para los importes, en la factura te redondeará a 4,59.
No sé si ésto responde a tu consulta.