Hola @JuanMan
Me parece que no te figura el campo REFERENCIA en la ME2N porque le debe faltar un tilde en el pedido de compras.
Por favor, verifica en el pedido de compras, dentro de las solapas de POSICION, especificamente en la solapa FACTURA, si tiene tildada la casilla de verificacion VerFactEM.
Si la tiene tildada, implica que toda factura estara vinculada con una recepcion de material (MIGO) y por ende, en el campo REFERENCIA te mostrara el valor cargado al momento de ingresar la MIGO.
Si no tiene el tilde, implica que no hay una RELACION DIRECTA entre las MIGO y las MIRO y por ello el campo REFERENCIA no te lo completa, ya que inclusive podrias ingresar una factura (MIRO) antes de recibir la mercaderia (MIGO).
Espero que esto sirva para resolver tu consulta.
Saludos,
Juan