Hola @Griiv
Primero que nada, revisa en la SE16N la tabla BSEG y fijate si en la linea(posicion) correspondiente a la cuenta contable que estás ejecutando la consulta de la FAGLB03, el campo BSEG-EBELN efectivamente contiene datos, porque puede suceder que estés queriendo visualizar, por ej., en una MIRO la cuenta del Acreedor y en forma estandar no se graba ese dato.
Gracias por lo comentado, encontré la solución, tuve que cargar como un campo adicional este dato, que aunque por defecto sale en el sistema, pareciera ser que no esta bien mapeada la información o simplemente no se realiza la consulta, como quiera por si alguien requiere en el futuro, solo es agregar el campo o cualquier otro campo desde la SPRO.