Buenos días @mig75
Estimado para poderte ayudar hay que conocer a detalle tu Proceso Productivo ya que de la forma que lo explicas no me queda claro porque no se si hay una Empresa Matriz y a su vez las Sedes funcionan como Centros de Distribución? No lo sé.
Como lo estas explicando entiendo que cada Sede tiene gastos tiene costos tiene personal si es así debes crearle Centros de Costos por cada Departamento, ósea es una fotografía de tu proceso.
Buen inicio de semana.