Hola que tal.
SAP Business One es modular en su funcionamiento pero es un único sistema, se instala como un todo y dependiendo de la actividad de la empresa, puedes o no utilizar todos los módulos.
Saludos.
Aquí hay algo de muy buena información que puede aclarar tu panorama, así como ha aclarado el mio: Versiones de SAP
Saludos.