El título dice una cosa, pero la consulta me parece que es otra.
Si vas por el tema de los montos muy grandes, te recomiendo leer este debate: Cambio Moneda VEF - Reconversión Monetaria
Si la pregunta es:
Tengo duda, a qué te refieres con registrar 1 misma factura, de forma parcial? Cómo quieres hacer eso? no entiendo 